Hóa đơn không chịu thuế GTGT: Khấu trừ hóa đơn đầu vào thế nào?

Hóa đơn đầu ra không chịu thuế GTGT: Khả năng khấu trừ hóa đơn đầu vào theo quy định mới?

Doanh nghiệp xuất hóa đơn đầu ra không chịu thuế, liệu hóa đơn đầu vào có được khấu trừ không? Điều này căn cứ theo Điều 5 Luật Thuế giá trị gia tăng 2024...

Quy định mới khấu trừ hóa đơn đầu vào với hóa đơn đầu ra không chịu thuế

Căn cứ Điều 5 Luật Thuế giá trị gia tăng 2024 quy định:

Đối tượng không chịu thuế

...

27. Cơ sở kinh doanh hàng hóa, dịch vụ không chịu thuế GTGT theo Điều này không được khấu trừ hoặc hoàn thuế GTGT đầu vào, trừ trường hợp áp dụng mức thuế suất 0% tại khoản 1 Điều 9 Luật này.

Theo khoản 16 Điều 4 Nghị định 181/2025/NĐ-CP quy định:

Đối tượng không chịu thuế

Thực hiện theo Điều 5 Luật Thuế GTGT. Một số trường hợp cụ thể như sau:

...

16. Cơ sở kinh doanh hàng hóa, dịch vụ không chịu thuế GTGT không được khấu trừ, không được hoàn thuế GTGT đầu vào, trừ khi áp dụng thuế suất 0% quy định tại khoản 1 Điều 9 của Luật Thuế GTGT.

Theo quy định trên, doanh nghiệp kinh doanh hàng hóa, dịch vụ không chịu thuế GTGT thì không được khấu trừ, không được hoàn thuế GTGT đầu vào.

Ngoài ra, doanh nghiệp có thuế GTGT của hàng hóa, dịch vụ chịu thuế (0%, 5%, 8%, 10%) và hàng hóa không chịu thuế GTGT sẽ thực hiện theo Điều 23 Nghị định 181/2025/NĐ-CP bổ sung bởi Khoản 2 Điều 3 Nghị định 144/2026/NĐ-CP:

- Thuế GTGT đầu vào của hàng hóa (gồm cả TSCĐ) và dịch vụ dùng cho cả hoạt động chịu thuế và không chịu thuế chỉ được khấu trừ phần dùng cho hoạt động chịu thuế.

- Phương pháp hạch toán & Phân bổ:

+ Hạch toán riêng: Doanh nghiệp phải tách riêng khoản thuế GTGT đầu vào được khấu trừ và không khấu trừ.

+ Phân bổ theo tỷ lệ doanh thu: Nếu không thể hạch toán riêng, sẽ tính theo % doanh thu chịu thuế so với tổng doanh thu bán ra trong kỳ.

Trong đó:

++ Tổng doanh thu bán ra bao gồm:

+++ Doanh thu hàng hóa, dịch vụ chịu thuế, không chịu thuế GTGT; doanh thu theo khoản 2 Điều 40.

+++ Vàng, bạc, đá quý: Giá trị gia tăng từ hoạt động mua, bán, chế tác (bỏ qua nếu âm).

+++ Kinh doanh ngoại tệ, chứng khoán: Chênh lệch giữa giá bán và giá mua (bỏ qua nếu âm).

++ Khấu trừ với dự án đầu tư hỗn hợp:

+++ Giai đoạn đầu tư: Thuế GTGT đầu vào của TSCĐ tạm khấu trừ theo tỷ lệ % doanh thu chịu thuế dự kiến.

+++ Điều chỉnh sau vận hành: Điều chỉnh theo tỷ lệ % doanh thu thực tế trong 03 năm đầu có doanh thu.

+++ Xử lý chênh lệch: Nếu giảm số thuế GTGT đã hoàn thì hoàn trả chênh lệch vào ngân sách mà không bị phạt hành chính.

++ Xác định doanh thu chịu thuế GTGT:

+++ Doanh thu bao gồm cả doanh thu hàng hóa, dịch vụ không cần kê khai, tính nộp thuế GTGT.

Thời hạn kê khai, khấu trừ thuế GTGT đầu vào ra sao?

Theo điểm đ khoản 1 Điều 14 Luật Thuế GTGT 2024 thời hạn kê khai, khấu trừ thuế GTGT đầu vào như sau:

- Thuế GTGT đầu vào phát sinh trong tháng/quý nào được kê khai, khấu trừ khi xác định số thuế phải nộp của tháng/quý đó. Số GTGT đầu vào chưa khấu trừ hết trong tháng/quý sẽ chuyển sang tháng/quý tiếp theo.

Trường hợp cơ sở kinh doanh phát hiện số thuế GTGT đầu vào khi kê khai, khấu trừ bị sai, sót, thì được khai thuế trước khi cơ quan thuế, cơ quan có thẩm quyền công bố quyết định kiểm tra, thanh tra thuế như sau:

- Người nộp thuế thực hiện khai bổ sung vào tháng, quý phát sinh số thuế GTGT đầu vào bị sai, sót. Nếu việc khai thuế vào tháng, quý phát sinh sai sót làm tăng số thuế phải nộp hoặc giảm số thuế được hoàn, người nộp thuế cần nộp đủ số thuế phải nộp tăng thêm, hoặc bị thu hồi số thuế đã hoàn tương ứng và nộp tiền chậm nộp vào ngân sách nhà nước (nếu có).

Người nộp thuế thực hiện khai vào tháng, quý phát hiện sai, sót nếu việc khai thuế vào tháng, quý phát sinh sai sót làm giảm số tiền thuế phải nộp hoặc chỉ làm thay đổi số thuế GTGT còn được khấu trừ chuyển sang tháng, quý sau.

Hiện nay có những loại hóa đơn nào?

Căn cứ tại Điều 8 Nghị định 254/2026/NĐ-CP quy định về các loại hóa đơn.

Theo đó, hiện nay có các loại hóa đơn sau:

(1) Hóa đơn giá trị gia tăng (GTGT)

Dành cho các tổ chức kinh tế khai thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ sử dụng cho các hoạt động:

• Bán hàng hóa, cung cấp dịch vụ trong nội địa.
• Hoạt động vận tải quốc tế.
• Xuất vào khu phi thuế quan và các trường hợp được coi như xuất khẩu.
• Xuất khẩu hàng hóa, cung cấp dịch vụ ra nước ngoài.
• Hoạt động kinh doanh thương mại điện tử, kinh doanh dựa trên nền tảng số và các dịch vụ khác của nhà cung cấp ở nước ngoài không có cơ sở thường trú tại Việt Nam.

(2) Hóa đơn bán hàng

Dành cho các tổ chức kinh tế, hộ, cá nhân kinh doanh khai thuế GTGT theo phương pháp trực tiếp áp dụng cho:

• Các hoạt động bán hàng, dịch vụ nội địa; vận tải quốc tế; xuất vào khu phi thuế quan và xuất khẩu ra nước ngoài.
• Tổ chức, cá nhân trong khu phi thuế quan khi bán hàng vào nội địa hoặc bán giữa các khu phi thuế quan với nhau (trên hóa đơn ghi rõ “Dành cho tổ chức, cá nhân trong khu phi thuế quan”).

(3) Hóa đơn thương mại điện tử

Áp dụng đối với các tổ chức kinh tế, hộ, cá nhân kinh doanh có hoạt động xuất khẩu hàng hóa, cung cấp dịch vụ ra nước ngoài và đáp ứng được điều kiện chuyển dữ liệu hóa đơn thương mại bằng phương thức điện tử đến cơ quan thuế.

(Trường hợp không đáp ứng điều kiện chuyển dữ liệu điện tử thì được lựa chọn lập hóa đơn GTGT điện tử hoặc hóa đơn bán hàng điện tử).

(4) Hóa đơn điện tử bán tài sản công

Sử dụng khi thực hiện bán, chuyển nhượng các tài sản công theo quy định của pháp luật về quản lý và sử dụng tài sản công.

(5) Hóa đơn điện tử bán hàng dự trữ quốc gia

Sử dụng khi các cơ quan, đơn vị thuộc hệ thống cơ quan dự trữ nhà nước thực hiện bán hàng dự trữ quốc gia.

(6) Các loại hóa đơn khác

• Tem, vé, thẻ theo định dạng chuẩn dữ liệu.
• Phiếu thu tiền cước vận chuyển hàng không; chứng từ thu cước phí vận tải quốc tế; chứng từ thu phí dịch vụ ngân hàng (được lập theo thông lệ quốc tế và quy định pháp luật liên quan).